南の猫の新西蘭雑記

日本も結構好きなのですが、根っこがこっちに深いです。

クリスパー:ゲノム編集とその行方:CRISPR, Genome Editing and More

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クリスパー・キャスナイン・システムとは

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特定された標的位置でDNAを切断するツールです。

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すでにゲノム編集に革命をもたらした技術ですが、

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科学者たちは常に

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さらなる可能性を探求しています。

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さて、クリスパーで他に何ができるのでしょう。

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クリスパー:ゲノム編集とその行方

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バクテリアの免疫システムとして発見されて以来、

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クリスパー・キャスナインは

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ゲノム研究の有力なツールとして改変されてきました。

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このシステムは二つの構成要素があります。f:id:minami-no-neko:20171109221032p:plain

DNAを切断するタンパク質、キャスナインと、

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ガイドRNAとして知られるRNA分子です。

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この二つの要素が結合して

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DNAを特異的に正確に切断できる複合体を形成します。

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まず、キャスナインが見つけて結合しなければならないのが、

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 PAMと呼ばれるゲノムの共通配列です。

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PAMと結合すると、

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ガイドRNAが二重螺旋の一部を解きます。

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このRNA

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特定されたDNAの配列と対応して結合する仕組みになっています。

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適合する配列を見つけると、

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キャスナインがDNAを切断します。

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二つのヌクレアーゼドメインにそれぞれ切り込みを入れ、

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二重螺旋を切断します。

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細胞は切断箇所を修復しようとしますが、

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修復過程においてよくエラーが起こります。

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そして思わぬ突然変異を導入することが度々あり、

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その遺伝子を無力化します。

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クリスパーは

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特定の遺伝子をノックアウトできる卓越したツールとなりました。

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でもクリスパーができるのは二重螺旋切断だけではありません。

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研究者たちの中には、

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キャスナインの一つあるいは両方の切断ドメインを非活性化し、

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そのタンパク質に新たな酵素を融合した者もいます。

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キャスナインはその酵素

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特定のDNA配列の位置まで輸送できます。

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例の一つとして、キャスナインと

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特定のDNA塩基を突然変異させる脱アミノ酵素と融合させ、

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シチジンをチミジンに置換することができました。

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このような正確なゲノム編集によって

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病気を引き起こす突然変異が

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健康なゲノムに置換できるようになりました。

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あるいは特定の位置で終止コドンを導入することも。

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しかし、ゲノム編集が全てではありません。

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遺伝子転写促進にクリスパーが使用できないかと、実験している研究所もあります。

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まず、キャスナインを完全に非活性化します。

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二重螺旋を切断できないようにするのです。

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代わりに転写活性化因子が添加されます。

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直接融合するか、ペプチドの鎖を使って。

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あるいは、活性化因子が

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ガイドRNAの代わりに組み込まれることもあります。

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添加された活性化因子は

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細胞の転写装置を組み込みます。

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RNAポリメラーゼや他の因子を

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標的位置に引き入れて、そのゲノムの転写量を増加します。

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同じ原理が遺伝子抑制にも応用できます。

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キャスナインと融合したKRABドメイン

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因子を組み込んで転写を非活性化させます。

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因子が実際の障害物となって遺伝子を遮断するのです。

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もっと独創的なクリスパーの使用法として

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この複合体に蛍光生タンパク質を添付するというものがあります。

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特定のDNA配列が

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細胞内のどの位置にあるか見えるようにするのです。

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これはゲノムの三次元構成の視覚化に役立ちます。

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あるいは染色体全体に添付させ、

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細胞核の中での位置を追跡したり。

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クリスパーはすでにこの分野の研究に大変化をもたらしています。

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しかしこうした新しい発想は

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今までに達成されてきた革新が

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氷山の一角でしかないことを示しています。

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クリスパーの可能性は無限です。

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次にはどんな応用法が生み出されるのか、

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クリスパー革命はまだまだ続くようです。

CRISPR: Gene editing and beyond - YouTube

和訳:南の猫